L'archivio storico dell'Orto botanico di Padova, custodito presso la Biblioteca storica di medicina e botanica Vincenzo Pinali e Giovanni Marsili, rappresenta un prezioso patrimonio documentario. I suoi documenti coprono un arco temporale che va dal Settecento al Novecento, offrendo una ricca testimonianza della storia dell'istituzione. Di particolare rilievo sono le lettere dei prefetti dell'Orto, che non solo raccontano l'evoluzione della botanica, ma offrono anche uno spaccato della societą tra il Risorgimento e la Grande Guerra, restituendo un quadro vivido di un'epoca di profondi cambiamenti. Tra il 2018 e il 2022 il Progetto di valorizzazione, riordino e inventariazione dell'archivio storico dell'Orto botanico di Padova (1763-1921), promosso dal Centro di Ateneo per le Biblioteche con la collaborazione dell'Archivio generale di Ateneo dell'Universitą di Padova, ha curato la conservazione, digitalizzazione e inventariazione dell'archivio, i cui documenti sono ora accessibili online su Phaidra, la piattaforma del Sistema Bibliotecario di Ateneo per l'archiviazione e la diffusione del patrimonio culturale digitale.