Firenze, Anno Domini 1540. Il Marchese Francesco Ambrosio Legato scopre che le tombe medicee sono state profanate. Devoto della famiglia medicea e di Lorenzo il Magnifico, ivi sepolto insieme al fratello Giuliano, decide di svelare chi possa esserci dietro un tale abominio. Frattanto, uno strano ed inquietante oggetto rinvenuto in quelle tombe fa precipitare Firenze nel caos più totale. Suicidi oscuri ed omicidi terribili fanno crescere la confusione. Il duca Cosimo dei Medici, da Palazzo Ducale, non comprende affatto ciò che sta succedendo, oramai privato del potere dall'invasore asburgico; mentre a Roma, una secolare Congrega presieduta da papa Paolo III non vuole affatto che s'indaghi. Attraverso una serie di eventi ed incontri più o meno casuali, il Marchese Ambrosio Legato si ritrova davanti ad una possibile verità sconcertante che riguarda anche la sua vita personale: spinto da strane circostanze, si reca ad Ebron, in Palestina. In quel luogo, un gioco molto più grande di lui si rivela come assoluto governatore della sua povera esistenza.

Napoli, nell'anno del Signore 1563. Filippo Bruno viene ordinato frate domenicano prendendo il nome di Giordano Bruno. Nel Convento di San Domenico Maggiore in Napoli, ove frate Giordano Bruno è novizio, l'atmosfera è tesa: strane cose vi accadono, ed oscure trame vi si intrecciano. Il frate filosofo, spronato da un suo misterioso compagno, inizia ad indagare. Troppo più grande di lui comincia ad apparire l'ingranaggio nel quale si muove frate Giordano! E troppo spaventosa è la verità che si cela tra quelle mura! Ma il filosofo nolano prosegue nelle sue ricerche, tra pericoli, inganni e sotterfugi di cui rischia di essere vittima innocente. Spinto in un peregrinare senza fine, per ogni dove, s'imbatte in strani personaggi e sempre più fitti misteri, convinto di arrivare alla verità definitiva che cerca, forse racchiusa in un antico libro nero, o forse presente in un criptico codice. Ma nel compimento delle miserabili cadute dell'uomo, un destino atroce ed imponderabile aleggia su di lui, e si rivelerà solo molto tempo dopo il suo sacrificio.